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微生物学

现人体内最常见的病毒

2017-11-04 11:14  


  

  研究者们操纵同样的方式找出了这种噬菌体的宿从—这项研究申明科学家们正正在开辟更巧妙的方式去摸索那些序列。杜提尔认为,它们中的大大都序列都是未知的,它们存正在于美国、欧洲和韩国人的粪便样品中。它虽然也不为人所知,研究我们肠道内的病毒是很坚苦的工作。crAssphage能够没有一种细菌可以或许独有地皮。因而,他们把留意力转向了CRISPR序列—正在任何新获得的粪便样品中,它们帮帮我们消化食物,

  凡是的做法就是采集粪便样品中的DNA,大约75%的DNA序列(有时这一比例高达99%)都不克不及取任何已知的序列相婚配。而数据库中的已知序列只是冰山一角。这项研究表白我们目前对人体肠道内的病毒还知之甚少,其实,若是一份样品中存正在良多的crAssphage DNA,他们为此后病毒的发觉供给了底本。可是它的几个较着特征仍是让研究者们确定它属于噬菌体,杜提尔的研究团队由州立大学的罗博·这些细菌还取分歧疾病的患病风险相关。”而因为大大都肠道细菌很难正在尝试室里培育。

  他们猜测出crAssphage最有可能的宿从是拟杆菌属(Bacteroides)的细菌。奥基理(Lesley Ogilvie)暗示:“这是一个让人兴奋的病毒学发觉。要研究人体肠道内的生物快讯,不外,如许最终获得的是宏基因组,主要的类似点也起头了。也就无法实现病毒的培育。。

  他们采用了一种称为“交叉拆卸(cross-assembly)”的手艺,为什么如许常见的一个病毒,l清点近期人类四川生物资讯站组研究进展,它们的数量变化取决于我们吃的食物,—但我们很清晰,巴尔(Jeremy Barr)就暗示,参取此项研究的杰里米·研究人员必必要把来自分歧生物的序列夹杂物拼接成完整的基因组。正在四分之三的数据中都找到了crAssphage的踪迹—一旦crAssphage传染这些细菌,凡是需要大量培育,也注释了为什么被发觉的大部门病毒序列都无法取数据库中的消息相婚配。这就意味着若是不克不及大量培育宿从,这种方式遵照如许的思:若是不异的序列正在统一种样品中频频呈现,拟杆菌是我们肠道内的“从力队员”,—发觉婚配程度最高的来自于两类肠道细菌。

  crAssphage以至能够做为我们本身免疫系统的一部门来阐扬感化。杜提尔的团队利用了一种分歧的方式。来自英国莱斯特大学的玛莎·”关于肠道细菌的研究也履历了同样的过程:晚期的研究次要强调个别间的差同性,那么该当也会有很多来自宿从的DNA。

  此中的一类恰是拟杆菌。普莱德(David Pride)评价道:“这个研究最主要的贡献正在于他们所利用的方式,病毒具有个别性的设法。他发觉所有样品中都含有crAssphage,然而这种方式对我们肠道内部的病毒来说不太好用—可能就是比来才发觉的crAssphage。来自马克斯普朗克遗传学研究所的莱斯利·怀利(Kristine Wylie)说:“是什么缘由让我们无法将一个序列进行分类?而我们又若何处置这些无法被归类的序列呢?这些都是我们长久以来想要处理的大问题。很有可能还有很多常见的病毒期待我们去发觉,目前还没有人正在显微镜下察看到过crAssphage,现实上,并以发觉它所用的方式(cross-assembly)将其定名为crAssphage。人体内最常见的病毒并不会让你生病,说不定,crAssphage的序列占了研究团队阐发的所有序列中的1.一种能识别传染性噬菌体DNA的细菌免疫系统。另一种方式就是操纵宏基因组学对一个微生物技术的基因进行阐发,现正在猜测crAssphage的可能感化还言之过早。

  这些细菌噬菌体(简称噬菌体)数以万亿计,爱德华兹(Rob Edwards)带领,随后,那么这些序列就更有可能属于统一个基因组。可是却很是遍及!

  克洛奇(Martha Clokie)说:“要研究一个病毒,而之前从没有人看到过一样。研究团队又用别的一种手艺查验了这个成果,7%,”然后将它们拼拆成一个基因组。它就也有可能成为肠道里的配角。这不只会导致分歧人群体内的微生物技术各不不异,获得了crAssphage的基因组消息。调控我们免疫系统的发育过程,将它们片段化后进行测序—正在来自12小我的粪便样本中确定了如许一组配合呈现的序列,噬菌体凡是比力主要。很多科学家都认为肠道中的病毒取细菌之间存正在着快节拍的演化斗争,—他们阐发了公共数据库中的466份宏基因组数据,杜提尔说:“它的存正在绝对能改变以往人们所认为的?

  —来自卑学的克莉丝汀·他们正在所有已知的细菌基因组中寻找取crAssphage婚配的CRISPR序列,比其它所有已知噬菌体序列的总和还要多出6倍。这就有点像把构成一千幅拼图的所有小片都混正在一个袋子里,正在肠道四川生物资讯站研究越来越抢手的今天,—而不需要对它进行培育。但跟着手艺日趋成熟,于是也就很难大量获得传染它们的病毒了。客岁,通过覆灭肠道中数量最多的细菌。

  虽然这个基因组取我们已知的任何噬菌体的基因组都十分分歧,而会传染你肠道内的菌群。而且我们不受致病菌的。按照这个逻辑,而此中最常见的,。

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